中医认为，人的脏腑气血的运行和自然界的气候变化密切相关。“用寒远寒，用热远热”，在采用性质寒凉的时，应避开寒冷的冬天或者寒冷的环境，而采用性质温热的时，应避开炎热的夏天或温燥的环境。人的体质年龄不同，品尝含有中药的火锅时也应有所差异。例如小儿体质娇嫩，选择原料不宜大寒大热。老人多肝肾不足，用药不宜温燥，孕妇恐动胎气，不宜用滑利之品。例如患有高血压、慢性咽炎、口腔炎、胃病、溃疡病、皮肤病、痔疮、肛裂、经常流鼻血、牙龈出血者以及属于“热体质”者忌食含有温热类滋补中药。不同的地区，气候条件、生活习惯有一定差异，人体生理活动和病理变化亦有不同。有的地处潮湿，比如西南地区火锅饮食多温燥辛辣，有的地处寒冷，比如东北地区饮食多热而滋腻，而南方饮食则多清凉甘淡，因此，在火锅药膳选料时要注意这些客观因素，选择如北虫草，枸杞等食物来滋补。药材没有经过的处理，起到的大都是去膻、除腥或者调味的作用，其滋补的功效并非一些商家所说的那么大。
除此之外，火锅生熟要得当，吃火锅时不宜过生或者过熟，菜肴过生不能有效地杀死表面所携带的致病菌或虫卵等，容易引起消化疾病过熟，菜肴中的维生素和氨基酸会遭到破坏，同时还会失去应有的鲜味。有的人特喜欢吃麻辣味，过麻，会使唇舌失去知觉，有味也品尝不到过辣，会刺激胃黏膜，诱发胃癌及不明原因的皮肤病。
不少人喜欢喝着啤酒吃火锅，要知道火锅汤中听普林物质在体内转化为尿酸，而啤酒则会使尿本酸分布在人体的关节或软组织之中，导致痛风症，严重时还会引起肾结石和尿毒症等并发症的发生。喝汤要趁早吃火锅时喝汤要趁早，否则涮得时间越久，汤中所含的有害残留物，如亚硝酸盐的含量就越高。

火锅直接加中药材难滋补，有滋补作用的中药材若想达到其养生效果，一般都需要一定的煎煮时间和工序流程，并不是说像有些火锅店那样，在汤料中直接放入诸如桂圆、桂皮、砂仁等生药材就成了滋补火锅。